极大螺旋藻藻胆蛋白α亚基基因的生物信息学分析

编号 zgly0000709148

文献类型 期刊论文

文献题名 极大螺旋藻藻胆蛋白α亚基基因的生物信息学分析

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 刘士伟  刘杰  李博生 

作者单位 北京林业大学生物科学与技术学院  北京林业大学螺旋藻研究所 

母体文献 安徽农业科学 

年卷期 2010(23)

页码 12773-12775

年份 2010 

分类号 Q946 

关键词 藻胆蛋白  α亚基  生物信息学 

文摘内容 [目的]对极大螺旋藻藻胆蛋白α亚基进行分析研究,为该蛋白的后续研究提供依据。[方法]用生物信息学分析方法对已经在GenBank上登录的极大螺旋藻藻胆蛋白的α亚基基因(GenBank AF441177)及其翻译的氨基酸序列进行了其组成和相关性质的分析、蛋白质信号肽预测、跨膜结构域的预测及亲水性/疏水性的测定,同时构建了分子进化树,对上述结果进行了分析和探讨。[结果]该蛋白的氨基酸组成丰富,不仅含18种必需氨基酸还含有甘氨酸、天冬氨酸等非必需氨基酸;对该蛋白信号肽和跨膜结构域分析表明,其属于胞内蛋白;对该蛋白的亲水性分析表明,其属于亲水性蛋白;进化树分析表明,该蛋白与钝顶节旋藻的同源性高,达99%～100%。[结论]该研究为α亚基和β亚基之间的关系和相互作用提供了一定依据。