黄瓜全基因组SnRK2基因的鉴定和序列特征分析

编号 zgly0000850187

文献类型 期刊论文

文献题名 黄瓜全基因组SnRK2基因的鉴定和序列特征分析

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 李利斌  曹齐卫  张允楠  孙小镭 

作者单位 山东省农业科学院蔬菜花卉研究所/山东省设施蔬菜生物学重点实验室/国家蔬菜改良中心山东分中心  山东农业大学园艺科学与工程学院 

母体文献 核农学报 

年卷期 2014(5)

页码 800-807

年份 2014 

关键词 黄瓜  蔗糖非发酵因子1相关蛋白激酶2  基因组分布  遗传进化  序列特征分析 

文摘内容 植物SnRK2基因在逆境应答和ABA信号转导及生长发育过程中具有重要功能。但是有关黄瓜(cucumis satovus L.)SnRK2全基因组水平的研究鲜见报道。本文利用生物信息学的方法从黄瓜基因组中鉴定出9个SnRK2基因,并对这些基因的染色体分布、内含子-外显子结构、系统进化、顺式调控元件等进行了系统分析。结果显示,黄瓜的SnRK2基因不均匀地的分布在基因组中,它们的外显子多数为9,编码区序列长度在909-1140bp之间。它们在遗传上分为3个不同的类群,预测编码的蛋白都具有激酶的典型结构。