小桐子SnRK2基因家族的全基因组鉴定及特征分析

编号 zgly0001529003

文献类型 期刊论文

文献题名 小桐子SnRK2基因家族的全基因组鉴定及特征分析

作者 王海波 

作者单位 曲靖师范学院云南高原生物资源保护与利用研究中心生物资源与食品工程学院  曲靖师范学院云南省高校云贵高原动植物遗传多样性及生态适应性进化重点实验室 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2016年09期

年份 2016 

分类号 S794.9 

关键词 小桐子  Sn RK2  蛋白激酶  基因组  序列特征分析 

文摘内容 蔗糖非发酵-1型相关蛋白激酶2(sucrose non-fermenting-1 related protein kinase 2,Sn RK2)属植物特有的一类Ser/Thr类蛋白激酶,参与植物体内多种信号转导途径及逆境胁迫的应答。基于小桐子基因组数据,利用生物信息学的方法鉴定到7个小桐子Sn RK2基因家族成员,并对其从系统进化、理化性质、基因结构及顺式作用元件等进行了分析。结果表明,小桐子Sn RK2基因在进化上较为保守,并聚类为3个亚家族。基因结构包含9~10个外显子,编码的蛋白序列都鉴定到典型的激酶结构域以及C末端酸性补丁区域。同时,在Sn RK2基因上游调控区域都鉴定到多个激素与逆境应答元件。表达分析显示,Sn RK2.1、Sn RK2.2在低温处理下上调表达显著,经过干旱处理,7个小桐子Sn RK2基因在叶中都上调表达,而Sn RK2.1、Sn RK2.2、Sn RK2.5上调表达量达到极显著水平(p<0.01)。本研究为进一步的克隆小桐子Sn RK2基因以及研究其在信号转导与激素、逆境应答中的功能提供了参考。