普通油茶种子4个发育时期的转录组分析

编号 zgly0000735621

文献类型 期刊论文

文献题名 普通油茶种子4个发育时期的转录组分析

学科分类 220.65;林业经济学

作者 林萍  曹永庆  姚小华  王开良  滕建华 

作者单位 中国林业科学研究院亚热带林业研究所  浙江省金华市婺城区东方红林场 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2011,9(4)

页码 498-505

年份 2011 

分类号 S794.4 

关键词 油茶(Camellia  oleifera)  Solexa测序技术  Unigene  Pathway 

文摘内容 我国油茶产业迅速发展,种苗繁育及栽培技术不断进步,但油茶分子基础研究薄弱,决定油茶产量、茶油质量、抗性等指标的重要经济、生长性状的分子机理研究甚少,这必将阻碍油茶产业的可持续发展。本项目首次采用高通量测序技术solexa技术对普通油茶＂长林4号＂无性系种子发育的4个时期转录组进行测序,经组装分析获得80 310条unigene,其中确定编码蛋白功能的有21 789条,分为24大类,占All-unigene的27.13%。通过与KEGG库比对,对42 638个unigene进行了Pathway注释,涉及的pathway有265个,主要包括新陈代谢、遗传信息加工、细胞代谢等相关pathway。这些相关研究为分析基因表达的数量及调控模式,分析基因表达调控元件的变化规律,揭示不同发育期基因表达差异等研究打下了良好基础,将为定向育种提供有力的理论指导和技术支持。