苏云金芽孢杆菌新基因cry1 Ab17的克隆和生物信息学

编号 zgly0000471928

文献类型 期刊论文

文献题名 苏云金芽孢杆菌新基因cry1 Ab17的克隆和生物信息学

学科分类 220.3020;森林昆虫学

作者 黄志鹏  关春鸿  黄必旺  邱君志  关雄 

作者单位 福建农林大学生物农药与化学生物学教育部重点实验室  福建农林大学生命科学学院 

母体文献 应用与环境生物学报 

年卷期 2006,12(1)

页码 64-67

年份 2006 

分类号 Q968  S476.11 

关键词 苏云金芽孢杆菌  cry1  Ab17基因  克隆  生物信息学 

文摘内容 利用高效克隆PCR产物的专用载体pMD18-T, 直接从苏云金芽孢杆菌WB9的PCR产物中克隆了cry1 Ab17新基因。测序结果表明, 该基因(GenBank登录号为AY646166)由3471个碱基组成, 其编码的蛋白质含有1156个氨基酸残基, 其中亲水性氨基酸占30.8%, 疏水性氨基酸占45.2%, 酸性氨基酸占12.9%, 碱性氨基酸占11.1%.氨基酸序列的同源性分析结果表明, Cry1 Ab17蛋白与已报道的Cry1Ab蛋白同源性为95.4%-99.7%, 该蛋白的4个氨基酸残基——Pro170、Gly449、Gly796和Gly863与其它已报道Cry1Ab蛋白相应位置的氨基酸残基均不同。在核苷酸序列和氨基酸序列多重比较的基础上, 应用PAUP4.0构建了Cry1A蛋白家族的系统发育树。