基于PCA和BP神经网络的O—糖基化位点的预测和模式分析

编号 zgly0000717885

文献类型 期刊论文

文献题名 基于PCA和BP神经网络的O—糖基化位点的预测和模式分析

作者 王楚正  谭晓风  陈延伟  何伟 

作者单位 中南林业科技大学计算机与信息工程学院  中南林业科技大学林学院 

母体文献 中南林业科技大学学报: 自然科学版 

年卷期 2010,30(9)

页码 61-65,75

年份 2010 

分类号 TP183 

关键词 O—糖基化  模式分析  主成分分析  BP神经网络 

文摘内容 糖基化是真核细胞中最常见的翻译后蛋白质修饰过程之一。传统的神经网络方法已被应用预测蛋白质糖基化位点,预测的准确性主要依赖于特征向量的维数(蛋白质序列的长度),并随着蛋白质序列长度的增加而提高,但网络的结构变得越来越复杂,增加了计算运行成本。为了解决这一问题,提出了主成分分析和BP神经网络相结合的新方法对O—糖基化位点进行预测和分析,用PCA提取主成分构造子空间以降低输入的蛋白质序列的维数,再用BP神经网络预测一个特定的蛋白质序列是否被糖基化。实验表明,提出的新方法能大大缩短计算时间,并能提高预测的准确性。