油桐种子FADX基因的克隆和序列分析

编号 zgly0000590312

文献类型 期刊论文

文献题名 油桐种子FADX基因的克隆和序列分析

学科分类 220.99;林学其他学科

作者 李元  汪阳东  李鹏  魏建民 

作者单位 内蒙古农业大学生物工程学院  中国林业科学研究院亚热带林业研究所 

母体文献 安徽农业科学 

年卷期 2008,36(11)

页码 4753-4755

年份 2008 

分类号 S794.3 

关键词 油桐  FADX基因  克隆  生物信息学分析 

文摘内容 [目的]克隆油桐种子FADX基因全长cDNA。对该基因作生物信息学分析，为进一步研究该基因的功能提供参考。[方法]以未成熟的油桐种子为材料，利用改良TRIzoL法提取总RNA，并根据GenBank中已经登录的α-桐酸合成酶基因FADX的序列，设计特异性引物；采用RT-PCR方法，克隆得到FADX基因全长cDNA，应用Antheprot软件和InterProScan对该基因进行了生物信息学分析。[结果]该序列5’端和3’端非编码区序列长度分别为13、47bp，含有1个开放阅读框(14—1174bp)，编码386个氨基酸，舍有典型的脂肪酸脱氢酶结构域；相对分子量是44343．0，理论等电点为8．33。二级结构预测表明，该蛋白α-螺旋含量占29％，β-折叠占32％，转角占6％。[结论]该蛋白属于脂肪酸脱氢酶。