大鼠尿激酶SYBR Green Ⅰ real time RT—PCR引物的设计

编号 zgly0000521404

文献类型 期刊论文

文献题名 大鼠尿激酶SYBR Green Ⅰ real time RT—PCR引物的设计

作者 田永红  熊锦文  丁晓芳  李红钢  黄东晖  熊承良 

作者单位 华中科技大学同济医学院计划生育研究所 

母体文献 生物信息学 

年卷期 2007,5(2)

页码 53-57

年份 2007 

分类号 Q959.837  Q78 

关键词 引物设计  生物信息学  软件 

文摘内容 设计用于SYBR Green Ⅰ法实时定量逆转录多聚酶链反应(QRT—PCR)检测大鼠尿激酶型纤溶酶原激活因子(uPA)mRNA的引物。从基因库获取靶基因及相关序列，充分收集和分析相关生物信息学数据，应用Oligo 6．22设计出一对长度为21bp的引物，其GC含量为52．4％；上下游引物3’最稳定二聚体和及发夹结构的能量分别为-1．5、-0．40kcal／mol和-3．5、-0．90kcal／mol，引物间最稳定二聚体为-3．1kcal／mol。5’端和中间AG值较高，高于3’端AG；引发效率分别455和403。实验证明，该引物能够高效、特异地实现对靶序列的检测，适用于SYBR GreenⅠ法实时定量检测(uPA)mRNA。