无蹼壁虎线粒体全基因组及系统发育分析

编号 zgly0001565607

文献类型 期刊论文

文献题名 无蹼壁虎线粒体全基因组及系统发育分析

作者 秦峰  曾德龙  高成伟  秦新民 

作者单位 广西师范大学生命科学学院 

母体文献 野生动物学报 

年卷期 2017年01期

年份 2017 

分类号 Q953 

关键词 无墣壁虎  线粒体基因组  系统发育 

文摘内容 经PCR扩增和序列测定,获得了无蹼壁虎(Gekko swinhonis)的线粒体基因组全序列,其总长为16 818 bp,含有13个蛋白质编码基因、2个rRNA基因、22个tRNA基因和1个控制区。各基因的位置、排列顺序及转录方向均和大部分的有鳞目物种一致。无蹼壁虎线粒体基因组的碱基组成分别为:A(31.35%)、T(26.28%)、C(27.71%)、G(14.67%)。除Ser(GCU)缺失DHU臂外,其余的21个tRNA都可以形成典型三叶草结构。13个蛋白质编码基因中,除ND2基因以ATA为起始密码子外,其余12个基因均使用ATG为起始密码子。无蹼壁虎5个基因(ND1、ATP8、ATP6、ND4L、ND4)以TAA为终止密码子,ND6和Cytb基因以TAG为终止密码子,CO1以AGA为终止密码,其余5个基因为不完全终止密码TA-或T-(ND2、CO2、ND5和CO3为T-,ND3为TA-)。控制区位于tRNAPro和tRNAPhe之间,全长1 456 bp,含有一些终止相关序列和保守序列(TAS,CBS1-3)。基于13个蛋白质编码基因氨基酸序列构建的BI系统发育树分析表明,无蹼壁虎与壁虎科的Tarentola mauritanica的亲缘关系最近。