萝卜中一种新dsRNA的全长cDNA克隆及序列分析

编号 zgly0001338112

文献类型 期刊论文

文献题名 萝卜中一种新dsRNA的全长cDNA克隆及序列分析

作者 李露露  李力强  乔爱民  陈亮  陈集双 

作者单位 浙江理工大学生物工程研究所  仲恺农业技术学院农业与园林学院 

母体文献 园艺学报 

年卷期 2008年08期

年份 2008 

分类号 S631.1 

关键词 萝卜  双链RNA  双分病毒科  Raphanus sativus virus 1 

文摘内容 从‘一点红’萝卜(Raphanus sativus-root‘Yidianhong’)叶片中提取dsRNA,应用SPAT方法对各dsRNA条带进行cDNA克隆并测序,除获得先前报道的5条序列(RasR1~Ras R5)以外,还得到一条新的全长序列,将其定名为RasR6(EU285027)。序列分析结果表明:RasR6全长为1778bp,其正义链编码1个由502个氨基酸组成、分子量约为55.1kD的蛋白质。该序列与前人报道的双分病毒科5个病毒序列具有相似性,且它们均编码双分病毒科病毒的外壳蛋白(capsid protein,CP)。核苷酸序列比对结果显示:RasR6与同时来源于萝卜的RasR1和RasR2的5′UTR序列高度同源,且其3′末端具有poly A结构,而与RasR3、RasR4和RasR5的UTR则没有明显的相似性。因此,推测RasR6与RasR1、RasR2同属于双分病毒RasV1(Raphanus sativus virus 1),可能与RasR2共同编码该病毒的CP或作为RasV1的卫星RNA存在。