茶树DELLA基因家族的鉴定及表达分析

编号 zgly0001721136

文献类型 期刊论文

文献题名 茶树DELLA基因家族的鉴定及表达分析

作者 韩雨欣  代洪苇  郑姝婷  童华荣  袁连玉 

作者单位 西南大学食品科学学院  食品科学与工程国家级实验教学示范中心(西南大学) 

母体文献 植物科学学报 

年卷期 2020年05期

年份 2020 

分类号 S571.1  Q943.2 

关键词 茶树  DELLA蛋白  表达分析  生物信息学 

文摘内容 利用生物信息学方法,从茶树(Camellia sinensis (L.) O. Ktze.)全基因组数据库中分析获得DELLA蛋白的家族成员,并对它们的系统进化关系、蛋白序列特征、基因表达特异性及其与茶树次生代谢物的相关性进行分析。结果显示:茶树基因组中共有5个DELLA基因,分别为:TEA009882 (CsGAI)、TEA022818 (CsRGA1)、TEA010112 (CsRGL1)、TEA008736 (CsRGL2)和TEA020933 (CsRGL3);其编码的氨基酸数量在525～594之间,均定位于细胞核。该蛋白的二级和三级结构分析结果表明,茶树DELLA蛋白结构中含有大量的α螺旋及少量β转角结构。蛋白保守结构域分析结果显示该蛋白与拟南芥(Arabidopsis thaliana (L.)Heynh.)具有高度的同源性,均具有GRAS、DELLA等保守结构域。基因的表达特异性分析结果表明,在茶树不同组织部位中,TEA009882、TEA022818和TEA010112基因的表达量均较高,而TEA020933和TEA008736的表达量在各组织中均较低;茶树DELLA基因的表达受到干旱、NaCl、低温及茉莉酸甲酯等非生物逆境胁迫的调控,且其表达量与茶树次生代谢物的积累间存在相关性。推测茶树DELLA基因广泛参与了茶树生长发育及非生物逆境胁迫的响应,以及对次生代谢物生物合成过程的调控。