纽荷尔脐橙贮藏枯水相关ESTs分离与初步分析

编号 zgly0001398090

文献类型 期刊论文

文献题名 纽荷尔脐橙贮藏枯水相关ESTs分离与初步分析

作者 许兰珍  刘小丰  何永睿  姚利晓  彭爱红  雷天刚  陈善春 

作者单位 中国农业科学院  西南大学柑桔研究所  国家柑桔品种改良中心  国家柑桔工程技术研究中心 

母体文献 园艺学报 

年卷期 2011年06期

年份 2011 

分类号 S666.4 

关键词 柑橘  果实  枯水  抑制性差减杂交  EST 

文摘内容 为分析柑橘果实贮藏过程中枯水相关特异基因的表达情况,以纽荷尔脐橙(Citrus Sinensis Osbeck)采摘后贮藏至略见枯水果实的果肉为测验方(Tester),以刚采摘果实的果肉为驱动方(Driver),采用抑制性差减杂交(Suppression Subtractive Hybridization,SSH)技术成功构建了贮藏果实差减cDNA文库,共获得656个阳性克隆。随机挑取克隆进行菌液PCR分析,插入片段长度主要集中在100～1000bp。成功对213个克隆进行测序,获得有效序列143条,经序列分析,共得到53条uniESTs序列。在NCBI基因库中对这53个uniESTs进行BLAST分析,比对结果参照MIPS的分类标准,按功能分为14类,其中参与代谢、能量及蛋白合成的ESTs最多,分别占到了全部ESTs的17%、11%和13%。