蝗虫肠道微生物总DNA提取方法的比较

编号 zgly0001360947

文献类型 期刊论文

文献题名 蝗虫肠道微生物总DNA提取方法的比较

作者 龙文敏  严二平  宣涛  魏华  庞小燕  赵立平  马恩波 

作者单位 山西大学应用生物学研究所  上海交通大学生命科学技术学院微生物分子生态学与基因组学实验室 

母体文献 昆虫知识 

年卷期 2009年03期

年份 2009 

分类号 S433 

关键词 蝗虫  肠道微生物  DNA提取  PCR-DGGE 

文摘内容 采用Bead beating法和QIAamp DNA stool mini kit法提取蝗虫肠道微生物总DNA,并对2种方法提取DNA的得率、完整性以及16SrRNA基因扩增产物的变性梯度凝胶电泳(denaturing gradient gel electrophoresis,DGGE)图谱等进行综合比较。结果表明,Bead beating法提取DNA的得率显著高于QIAamp DNA stool mini kit法(P=0.042),而QIAamp DNA stool mini kit法提取DNA片段更完整。PCR-DGGE检测微生物多样性结果显示,QIAamp DNA stool mini kit法提取DNA所代表的微生物群落多样性略高于Bead beating法,但Mann-Whitley统计学检验表明用2种方法检测蝗虫肠道微生物多样性无显著差异(P=0.17)。因此在蝗虫肠道微生物群落多样性的检测中QIAamp DNA stool mini kit法具一定的优势,而Bead beating法同样适用。