木霉属补充DNA条形码筛选(英文)

编号 zgly0001479391

文献类型 期刊论文

文献题名 木霉属补充DNA条形码筛选(英文)

作者 朱兆香  曾昭清  庄文颖 

作者单位 中国科学院微生物研究所真菌学国家重点实验室  吉林农业大学食药用菌教育部工程研究中心 

母体文献 菌物学报 

年卷期 2014年06期

年份 2014 

分类号 Q939.11 

关键词 种内与种间序列差异  PCR扩增与测序成功率  rpb2 

文摘内容 木霉属真菌是一类重要的生物资源,在工农业、环境保护等方面具有较高经济价值,对其进行快速、准确的物种鉴定兼具理论意义和应用前景。以木霉属35个概念清晰的种为材料,选择I TS、rpb2和tef1作为候选基因序列,利用T axon Gap对231个序列片段进行分析,将种内与种间序列差异以及序列获取难易程度作为评价指标,筛选该属的补充条形码片段。结果表明,r pb2具有适宜的种内与种间序列差异,其最小的种间差异(2.48%),大于最大种内差异(1.8%),种内、种间遗传距离存在明显的间隔区,并且该基因序列具有较高的P CR扩增与测序成功率(94.4%);I TS和t ef1基因序列的种内与种间序列差异之间存在交叉重叠。因此建议r pb2作为木霉属的补充D NA条形码序列。