编号
zgly0001671871
文献类型
期刊论文
文献题名
葱兰夜蛾幼虫肠道细菌群落结构与多样性分析
作者单位
浙江农林大学林业与生物技术学院
母体文献
浙江林业科技
年卷期
2019年02期
年份
2019
分类号
S436.8
关键词
葱兰夜蛾
幼虫
肠道细菌
多样性
16SrDNA
高通量
文摘内容
为明确葱兰夜蛾Brithys crini(Fabricius,1775)幼虫肠道细菌的群落结构和多样性,利用IonS5TMXL高通量测序平台对肠道细菌16S rDNA基因V3-V4变异区进行测序,应用Cutadapt、Uparse等软件整理、统计样品序列数和OUT数,分析肠道细菌的物种组成、丰度和多样性。4个虫体肠道样本测序拼接后,共得273 453条序列和在97%相似度下平均每个样本可聚类为512个OTU数目,总共注释到23门57纲86目168科347属,优势菌群为变形菌门Proteobacteria和厚壁菌门Firmicute。葱兰夜蛾肠道细菌Simpson指数、Shannon指数和Chao1指数分别为0.93~0.98,5.67~6.82和439.57~584.12。结果表明葱兰夜蛾幼虫肠道细菌多样性比较丰富,个体间微生物群落结构和多样性有差异。