“金手指”香蕉抗枯萎病基因同源序列的克隆与分析(英文)

编号 zgly0001371372

文献类型 期刊论文

文献题名 “金手指”香蕉抗枯萎病基因同源序列的克隆与分析(英文)

作者 孙德权  胡玉林  张鲁斌  莫亿伟  谢江辉 

作者单位 中国热带农业科学院南亚热带作物研究所 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2009年06期

年份 2009 

分类号 S668.1 

关键词 香蕉  枯萎病  抗病基因同源序列  核苷酸结合位点 

文摘内容 本研究以抗镰刀菌枯萎病香蕉种质金手指(AAAB)为材料,根据已克隆的抗枯萎病基因的 NBS保守结构域设计简并引物,通过同源序列克隆获得了 20 条来自基因组 DNA 的 RGA 片段,大小为 530 bp 左右。根据其推断的氨基酸序列,经保守结构域分析,其结构域均为 NB-ARC,属于 non-TIR-NBS 类候选抗病基因类序列。它们均具有 P-loop (GMGGVGKTT),Kinase-2 (LLVLDDIW),RNBS-B (CKVLFTTRS)以及疏水氨基酸结构域 GLPL (GLPLALKVL)等 4 个保守氨基酸基元。20 个 RGA 之间核苷酸序列的相似性在 41.1%～99.3%之间,氨基酸序列的相似性在 33.2%～96.3%之间。同时,对分离得到的 20 条 RGAs 进行系统发育树分析,发现它们分布在 5 个不同的区域。并且所编码的氨基酸序列与已知抗枯萎病基因 Fom-2、I2C-1、I2C-2和 I2 等编码的氨基酸序列表现出 28%～54%的同源性,证明了抗病基因在进化上具有一定的保守性。因此,这些抗病基因同源片段(RGA)的分离将为进一步从香蕉中分离抗枯萎病基因打下基础,也可作为分子标记筛选香蕉抗枯萎病的候选基因。