苹果全基因组SBP-box基因家族分析及代表成员的分子克隆

编号 zgly0000899410

文献类型 期刊论文

文献题名 苹果全基因组SBP-box基因家族分析及代表成员的分子克隆

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 张晓辉  魏小春  李锡香  孙玉燕  王冠  常兆晶  刘冠群  邱杨  宋江萍  王海平  沈镝  王大江  韩月澎 

作者单位 中国农业科学院蔬菜花卉研究所  农业部园艺作物生物学与种质创制重点实验室  中国农业科学院果树研究所  中国科学院武汉植物园 

母体文献 园艺学报 

年卷期 2014(2)

页码 215-226

年份 2014 

关键词 苹果  SBP-box家族  分子进化  基因克隆 

文摘内容 从金冠苹果基因组中鉴定出33个SBP-box家族基因,其中20个为miR156的靶基因。通过进化分析,对该家族成员进行了系统分类和功能预测。大部分预测的基因在富士苹果基因组中存在并表达,并且发现可变剪切在该家族基因中高频出现。在富士苹果中克隆了4个代表性成员基因,即MdSPL2、MdSPL11、MdSPL13和MdSPL33;与金冠相比,MdSPL33是一个缺失第2和3外显子的剪切本,并具有2个单碱基变异;MdSPL11和MdSPL13分别存在4个和2个单碱基变异,造成3个和1个氨基酸改变。