编号
zgly0000564157
文献类型
期刊论文
文献题名
云斑车蝗线粒体基因组全序列测定与分析
学科分类
220.3020;森林昆虫学
作者单位
陕西师范大学生命科学学院
母体文献
昆虫学报
年卷期
2008,51(7)
页码
671-680
年份
2008
分类号
Q966
关键词
直翅目
蝗总科
云斑车蝗
线粒体基因组
RNA二级结构
重复序列
文摘内容
采用长距PCR扩增及保守引物步移法并结合克隆测序测定并注释了云斑车蝗Gastrimargus marmoratus(Tbunberg)的线粒体基因组全序列。结果表明:云斑车蝗线粒体基因组全序列为15904bp(GenBank登录号为EU527334),A+T含量略高于非洲飞蝗Locusta migratoria,为76.04%,包括13个蛋白质编码基因,22个tRNA基因,2个rRNA基因和一段1057bp的A+T富集区。蛋白质基因的起始密码子中,除COI和ND5为TTG以外,均为昆虫典型的起始密码子ATN。ND5基因使用了不完全终止密码子T,其余基因均为典型的TAA或TAG。预测了22个tRNA基因的二级结构,发现tRNA^ser(AGN)缺少DIdU臂,tRNA^ser(UGY)的反密码子环上有9个碱基。预测了云斑车蝗12s和16SrRNA二级结构,分别包括3个结构域30个茎环和6个结构域44个茎环。A+T富集区含有3个串联重复序列。