喀斯特原生土壤与退化生态系统土壤细菌群落结构

编号 zgly0001354501

文献类型 期刊论文

文献题名 喀斯特原生土壤与退化生态系统土壤细菌群落结构

作者 陈香碧  苏以荣  何寻阳  魏文学  魏亚伟  代晓燕 

作者单位 中国科学院亚热带农业生态研究所亚热带农业生态重点实验室  中国科学院研究生院  华中农业大学资源环境学院 

母体文献 应用生态学报 

年卷期 2009年04期

年份 2009 

分类号 S154.3 

关键词 喀斯特  16S rDNA  细菌多样性  基因型  PCR-RFLP  系统发育 

文摘内容 运用PCR-RFLP技术,对桂西北喀斯特原生土壤和退化生态系统土壤细菌16S rDNA基因多样性及系统发育关系进行了研究.结果表明:原生土壤比退化生态系统土壤具有更丰富的16S rDNA基因型和更高的多样性指数,两样地共有的基因型仅有2个.从每种基因型中随机选择一个克隆子作为代表进行测序分析,所有序列与GenBank数据库中序列的同源性为87%～100%,且两样地中均有超过一半的基因型序列与数据库中已知序列同源性低于97%,属于分类在种地位上的新发现细菌;通过系统发育研究将两样地的细菌分为10大类群,两样地共同拥有5大类群,但两样地的细菌优势类群明显不同,原生土壤为Proteobacteria,含39种基因型,占总克隆子数的58.0%,退化生态系统土壤为Acidobacteria和Proteobacteria,分别含19种和15种基因型,占总克隆子数的32.5%和30.5%;与原生土壤细菌类群相比,退化生态系统土壤Proteobacteria类群明显减少,Acidobacteria类群明显增加.土壤理化性质及土壤环境因素的差异是引起两类型土壤细菌多样性差异的原因.