基于转录组测序对紫花苜蓿铅胁迫相关基因的富集分析

编号 zgly0001691721

文献类型 期刊论文

文献题名 基于转录组测序对紫花苜蓿铅胁迫相关基因的富集分析

作者 郭强  王英哲  王昆  徐博 

作者单位 吉林农业大学动物科学技术学院  吉林省农业科学院  黑龙江省二九一农场畜牧兽医科 

母体文献 草业科学 

年卷期 2019年10期

年份 2019 

分类号 S541.9  X503.231 

关键词 紫花苜蓿  转录组  铅胁迫  耐铅基因 

文摘内容 本文采用高通量Illumina Hiseq测序平台对紫花苜蓿(Medicago sativa)的铅胁迫处理组(Pb96)和对照组(CK)进行转录组测序,并对测序数据进行分析,探究紫花苜蓿抗铅应答的分子机制。结果表明,在铅胁迫处理下共检测到2 242个差异表达基因(Differentially expressed genes,DEGs)。其中,1 321个DEGs上调表达,921个DEGs下调表达。GO (Gene ontology,http://www.geneontology.org/)富集分析,差异表达基因主要涉及物质代谢、蛋白结合、催化活性等。KEGG (Kyoto encyclopedia of genes and genomes,http://www.genome.jp/kegg/)分析,差异基因主要涉及代谢途径、光合作用、淀粉和蔗糖代谢等。COG (Clusters of orthologous groups of proteins/orthologous groups of genes)分析,差异基因主要涉及碳水化合物的运输和新陈代谢、翻译、核糖体结构和生物发生、次生代谢产物的生物合成、转运和分解代谢等。本研究通过对紫花苜蓿根系转录组分析,为研究紫花苜蓿耐铅分子机制提供参考。