短额负蝗线粒体基因组及其lrRNA和srRNA二级结构分析

编号 zgly0000521783

文献类型 期刊论文

文献题名 短额负蝗线粒体基因组及其lrRNA和srRNA二级结构分析

学科分类 220.3020;森林昆虫学

作者 丁方美  师红雯  黄原 

作者单位 陕西师范大学生命科学学院 

母体文献 动物学研究 

年卷期 2007,28(6)

页码 580-588

年份 2007 

分类号 Q969.26  Q754 

关键词 线粒体基因组  rRNA二级结构  短额负蝗  锥头蝗科  直翅目 

文摘内容 采用长距PCR扩增及保守引物步移法测定并注释了短额负蝗的线粒体基因组全序列。结果表明，短额负蝗的线粒体基因组全长15558bp，A＋T含量为74．3％，37个基因位置与飞蝗的一致，基因间隔序列共计11处64bp，间隔长度从1～16bp不等；有15对基因间存在51bp重叠，重叠碱基数在1～8bp之间。13个蛋白质编码基因中找到6种可能的起始密码子，有12个基因在基因3’端能找到完全的TAA或TAG终止密码子，只有ND5基因终止密码子为不完整的TA。除tRNA^Ser(AGN)外，其余21个tRNA基因的二级结构均属典型的三叶草结构。tRNA^Ser(AGN)的DHU臂缺失，在相应的位置上只形成一个环。预测的lrRNA二级结构总共有6个结构域(结构域Ⅲ缺失)，49个茎环结构。预测的srRNA的二级结构包含3个结构域，33个茎环结构。A＋T丰富区中存在一个被认为与复制及转录起始有关的Ploy(T)(T-stretch)结构。