一株野鸟源H3N8亚型流感病毒分离株的全基因组序列分析

编号 zgly0001517198

文献类型 期刊论文

文献题名 一株野鸟源H3N8亚型流感病毒分离株的全基因组序列分析

作者 兰玲  王涛  王晶  程子兵  邓国华  陈化兰 

作者单位 新疆动物卫生监督所  中国农业科学院哈尔滨兽医研究所/兽医生物技术国家重点实验室/农业部动物流感重点实验室  塔城市动物疫控中心 

母体文献 中国动物检疫 

年卷期 2016年04期

年份 2016 

分类号 S852.65 

关键词 流感病毒  H3N8亚型  基因组分析 

文摘内容 本研究对2014年从新疆额敏县分离到的一株野鸟源H3N8亚型流感病毒A/wild bird/Xinjiang/S3525/2014（H3N8）进行了全基因序列和进化分析。序列分析显示,HA裂解位点序列为339PEKQTR-GLFG348,为典型的低致病性禽流感病毒特征,NA基因具有6个潜在的糖基化位点,与病毒株A/mallard/Czech Republic/14333-1K/2011（H3N8）核苷酸高度同源（97.7%）。该毒株的内部基因来源较复杂,其PB1、NP基因分别与A/ruddy shell duck/Mongolia/921C2/2009（H7N1）和A/wild duck/Korea/MHC39-26/2011（H7N9）的同源性最高,其余内部基因与H2、H3、H6、H7等亚型禽流感病毒分离株同源性最高,呈现明显的异源性。除PB2基因外,其余基因片段均来源于野鸟源禽流感病毒。