擎天凤梨GAPDH基因的克隆及序列分析

编号 zgly0000649818

文献类型 期刊论文

文献题名 擎天凤梨GAPDH基因的克隆及序列分析

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 刘建新  张智  丁华侨  葛亚英  王炜勇 

作者单位 浙江省农业科学院花卉研究开发中心 

母体文献 浙江农业学报 

年卷期 2010,22(6)

页码 722-726

年份 2010 

分类号 S682.1 

关键词 擎天凤梨  GAPDH  克隆 

文摘内容 管家基因GAPDH(glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase)常被用作定量、半定量PCR试验的内参,以确定目标基因的相对表达量。基于前期从全长cDNA文库中获得GAPDH基因的EST单克隆,进行PrimerWalking测序,获得一个GAPDH的全长cDNA序列,序列长1 790 bp,编码421个蛋白氨基酸,命名为GoGAP-DH1。采用Blast,ExPASy,ProtParam,SPOMA,Find Conserved Domains(NCBI),ClustalX,MEGA等生物信息学软件对cDNA序列、氨基酸序列、保守区、亲缘关系等特征进行分析。结果表明,GoGAPDH1与玉米的细胞质GAPDH基因源性最高,为82%。初步推断GoGAPDH1可能是一个胞质型GAPDH。