我国部分地区沙地葡萄茎痘相关病毒分离物外壳蛋白序列变异分析

编号 zgly0001468374

文献类型 期刊论文

文献题名 我国部分地区沙地葡萄茎痘相关病毒分离物外壳蛋白序列变异分析

作者 朱红娟  胡国君  范旭东  张尊平  任芳  董雅凤 

作者单位 中国农业科学院果树研究所  国家落叶果树脱毒中心 

母体文献 植物保护学报 

年卷期 2014年02期

年份 2014 

分类号 S436.631.1 

关键词 沙地葡萄茎痘相关病毒  RT-PCR检测  序列分析 

文摘内容 为明确我国葡萄中沙地葡萄茎痘相关病毒(GRSPaV)的感染情况及病毒外壳蛋白(coat protein,CP)基因的变异特点,从而为其致病性、病害的防治以及抗病毒基因工程等研究提供依据,本研究对采自我国16个省市自治区的65个葡萄品种305株葡萄样品中的GRSPaV进行RT-PCR检测,根据地区与品种差异选取了24个阳性样品进行cp基因克隆与测序分析,并对不同RNA提取方法进行了比较。结果显示,114株样品被GRSPaV侵染,平均带毒株率为37.4%;分离物间及同一分离物不同克隆间的序列差异较大,从24个分离物克隆获得的37条cp基因序列与来源于不同国家的12个GRSPaV分离物的核苷酸序列同源性为80.5%~99.7%,氨基酸序列同源性为88.8%~100%;各个分离物的遗传距离无明显地域差异;SiO2吸附法比SDS法和CTAB法更适宜葡萄样品RNA的提取。