毛竹bZIP转录因子的基因结构与进化分析

编号 zgly0001006289

文献类型 期刊论文

文献题名 毛竹bZIP转录因子的基因结构与进化分析

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 张庆波  胡尚连  徐刚  曹颖  卢学琴  龙治坚 

作者单位 西南科技大学植物细胞工程实验室  四川省生物质资源利用与改性工程技术研究中心 

母体文献 森林与环境学报 

年卷期 2016(1)

页码 54-61

年份 2016 

关键词 毛竹  bZIP转录因子  生物信息学分析 

文摘内容 以毛竹基因组数据库中的107个编码b ZIP转录因子的基因为材料,对其进行系统发育分析,筛选得到了A、D和S亚族的b ZIP家族成员,并对其基因结构、适应性进化、与水稻基因对之间的进化分歧时间及蛋白质同源建模等进行生物信息学分析。结果表明,毛竹A、D和S亚族共有47个b ZIP家族成员,其中A亚族18个,D亚族16个,S亚族13个。基因结构分析表明,3个亚族中内含子数量为0-16个,而且D亚族基因的内含子—外显子组成比A亚族和S亚族更为复杂。