苹果抗炭疽菌叶枯病基因SNP和InDel标记的HRM筛选

编号 zgly0001540186

文献类型 期刊论文

文献题名 苹果抗炭疽菌叶枯病基因SNP和InDel标记的HRM筛选

作者 刘源霞  兰进好  柏素花  孙晓红  刘春晓  张玉刚  戴洪义 

作者单位 青岛农业大学园艺学院青岛市园艺植物遗传改良与育种重点实验室  青岛农业大学农学与植物保护学院  青岛农业大学生命科学学院 

母体文献 园艺学报 

年卷期 2017年02期

年份 2017 

分类号 S436.611.1 

关键词 苹果  高分辨率熔解曲线  炭疽菌叶枯病  SNP标记  InDel标记  精细定位 

文摘内容 以207株‘金冠’与‘富士’苹果的F1杂交分离群体实生树为试材,挑选抗炭疽菌叶枯病基因Rgls位点区域内的,第15条染色体上,位于SSR标记S0304673和S0405127之间500 kb物理距离内,由全基因组重测序技术所获得的与抗该病相关的10个SNP及10个InDel标记,通过高分辨率熔解曲线（High Resolution Melting,HRM）技术筛选出与基因Rgls位点紧密连锁的2个SNP及4个InDel标记。通过对重组个体的基因型及表型分析,发现标记InDel4227和InDel4254表现出与Rgls基因位点共分离,将基因Rgls精细定位于标记InDel4199和SNP4299之间100 kb的物理距离内。对该基因位点两侧4.14.3Mb距离内的基因进行统计分析,表明在该区段内存在40个有功能注释的基因,涉及到细胞组成、分子功能和生物过程方面共19个GO分类。