东北林蛙PDK1基因的克隆及生物信息学分析

编号 zgly0001561742

文献类型 期刊论文

文献题名 东北林蛙PDK1基因的克隆及生物信息学分析

作者 巩珊珊  邵婕  曲俐俐  柴龙会  张晶钰  肖向红 

作者单位 东北林业大学野生动物资源学院 

母体文献 野生动物学报 

年卷期 2017年04期

年份 2017 

分类号 Q953 

关键词 东北林蛙  PDK1基因  基因克隆  生物信息学分析 

文摘内容 PDK1是PI3K/Akt信号通路中的一个重要的激酶。在哺乳动物中,PI3K/Akt信号通路是一条保守的通路,通过激活下游的因子对糖代谢、脂肪代谢以及蛋白质代谢,细胞的增殖、分化、凋亡等起调节控制作用。本研究基于东北林蛙转录组数据,从中鉴定出PDK1基因3条Unigene序列,并通过RACE法克隆了PDK1基因的全长cDNA,命名为rdPDK1,其全长为1 990 bp,开放阅读框长1 674 bp,编码557个氨基酸。进行生物信息学分析,推测该基因编码的蛋白质相对分子质量63.7 kD,等电点为7.21。该蛋白第82~344个和443~549个氨基酸是2段保守结构域STKc激酶域和PH调节结构域。同源性分析表明rdPDK1蛋白与HsPDK1蛋白氨基酸序列一致率为79%,相似率为100%;与MmPDK1蛋白氨基酸序列一致率为80%,相似率为100%。本研究结果有望为进一步研究东北林蛙PI3K/Akt信号通路中PDK1基因的特性及功能奠定基础。