切花菊耐寒性相关SNP位点挖掘与候选基因分析

编号 zgly0001689413

文献类型 期刊论文

文献题名 切花菊耐寒性相关SNP位点挖掘与候选基因分析

作者 范宏虹  徐婷婷  苏江硕  孙炜  种昕冉  管志勇  房伟民  陈发棣  张飞 

作者单位 南京农业大学园艺学院作物遗传与种质创新国家重点实验室 

母体文献 园艺学报 

年卷期 2019年11期

年份 2019 

分类号 S682.11 

关键词 菊花  耐寒性  全基因组关联分析  候选基因 

文摘内容 以58份切花菊为试验材料,调查了脚芽期、现蕾期和盛花期叶片以及盛花期舌状花低温半致死温度(LT50),利用全基因组关联分析挖掘耐寒性相关优异等位变异和候选基因。结果表明,切花菊品种不同时期叶片或盛花期舌状花耐寒性变异较大,变异系数均大于25%;通过主效可加互作可乘(AMMI)模型的双标图分析筛选出抗寒性强且稳定性较好的品种‘天使’。基于36737个高质量SNP位点和混合线性模型的关联分析,共挖掘出24个与耐寒性显著关联的SNP位点(P<0.001),其中有5个、11个和5个SNP位点分别与脚芽期、现蕾期、盛花期叶片耐寒性相关,3个SNP位点与盛花期舌状花耐寒性相关;5个SNP位点的表型效应值小于–4℃,为优异等位变异位点。通过显著性SNP位点所在的SLAF标签序列与菊花转录组数据库进行比对分析,筛选得到5个候选基因,其中CL2042.Contig4_All和Unigene40993_All可能与冷胁迫有一定关联。