大熊猫和北极熊基因组微卫星分布特征比较分析

编号 zgly0000886773

文献类型 期刊论文

文献题名 大熊猫和北极熊基因组微卫星分布特征比较分析

学科分类 220.35;野生动物保护与管理

作者 李午佼  李玉芝  杜联明  黄杰  沈咏梅  张修月  岳碧松 

作者单位 四川省濒危野生动物保护生物学重点实验室  四川大学生命科学学院  成都中医药大学药学院  四川好医生攀西药业有限责任公司 

母体文献 四川动物 

年卷期 2014(6)

页码 874-878

年份 2014 

关键词 大熊猫  北极熊  基因组  微卫星 

文摘内容 本研究比较分析了大熊猫和北极熊全基因组序列中的1~6碱基重复的完美型微卫星序列的分布特征,通过微卫星序列搜索和统计软件MSDB分析分别得到855 018和936 238个微卫星序列,其长度总和分别是14 919 240 bp和18 434 348 bp;分别占基因组大小的0.64%和0.79%,大熊猫和北极熊基因组总丰度分别是371.8个/Mb和405.6个/Mb,二者基因组中微卫星都是单碱基重复的最多,其次是二碱基、四碱基、三碱基和五碱基,六碱基重复类型的数量最少。大熊猫和北极熊含量最丰富的重复拷贝类别主要有A、AC、AG、AAAT、AAAG、AT和C等。