传染性支气管炎病毒广西分离株S1基因克隆与序列分析

编号 zgly0001478264

文献类型 期刊论文

文献题名 传染性支气管炎病毒广西分离株S1基因克隆与序列分析

作者 陈丽  薛瑜  李广伟  陈峰  孙宝丽  谢青梅 

作者单位 华南农业大学动物科学学院  广东温氏食品集团股份有限公司 

母体文献 动物医学进展 

年卷期 2014年03期

年份 2014 

分类号 S852.659.6 

关键词 传染性支气管炎病毒  S1基因  序列分析 

文摘内容 近年来,鸡传染性支气管炎(IB)在我国广西地区相继暴发,流行十分广泛,给养禽业带来巨大损失。为及时了解传染性支气管炎病毒(IBV)的变异情况,从而进行更有效的防控,本研究对2012年分离自广西的8株IBV的S1基因进行了序列测定与分析。参考NCBI上的IBV S1基因序列,设计合成了一对扩增S1基因全长序列的引物。采用RT-PCR方法对8株IBV分离株(GX1-GX8)的S1基因进行克隆测序。序列分析结果表明,8株IBV分离株S1基因全长均为1620bp,且集中分布在2个分支,GX1-GX4属于第Ⅴ分支,其裂解位点均为RRFRR;GX5-GX8属于第Ⅰ分支,其裂解位点均为HRRRR,为IBV中国毒株所特有。同时,这些分离株进化趋势与其分离时间之间显示出一定的相关性;潜在糖基化位点(PGS)分析结果显示,GX1-GX4的PGS分布一致且与GX5-GX8的分布显示出一定的差异;核苷酸同源性分析结果表明,位于同一分支的毒株间同源性较高,所有分离毒株与我国使用的常规Mass型疫苗毒株的同源性均偏低。这暗示目前广西IBV分离毒株与我国广泛使用的IB疫苗毒株的遗传进化距离较远,常规Mass型疫苗可能起不到很好的免疫保护作用。