双生病毒的同义密码子用法及其进化分析

编号 zgly0001338350

文献类型 期刊论文

文献题名 双生病毒的同义密码子用法及其进化分析

作者 徐晓忠  刘庆坡  樊龙江  周雪平 

作者单位 浙江大学农业与生物技术学院  浙江林学院农业与食品科学学院 

母体文献 植物病理学报 

年卷期 2008年05期

年份 2008 

分类号 S432.41 

关键词 双生病毒  密码子用法  相对同义密码子使用频率  聚类分析  进化 

文摘内容 对双生病毒编码基因的变异进行了密码子用法分析,推测双生病毒基因的表达水平普遍不高,而外壳蛋白基因的表达水平相对较高,它们在密码子第3位上偏好使用A或T。双生病毒的密码子用法主要受到突变偏好和翻译选择等因素的影响。双生病毒的密码子使用具有基因特异性和一定程度的寄主特异性。基于相对同义密码子使用频率的聚类分析可以很好反映侵染单子叶植物和双子叶植物双生病毒之间的差异,也在一定程度上反映出双生病毒之间的亲缘关系。