松乳菇ITS序列比较及其在乳菇属中的系统发育分析

编号 zgly0001445268

文献类型 期刊论文

文献题名 松乳菇ITS序列比较及其在乳菇属中的系统发育分析

作者 陈玉华  刘君昂  周国英  李河  王圣洁  路宗岩 

作者单位 中南林业科技大学林学院  经济林培育与保护教育部重点实验室  中南林业科技大学 

母体文献 食用菌学报 

年卷期 2013年01期

年份 2013 

分类号 S646 

关键词 松乳菇  ITS序列  系统发育 

文摘内容 提取江苏、云南、江西、湖南、广西、安徽、湖北地区的松乳菇(Lactarius deliciosus)、红汁乳菇(L.hatsudake)、橙色乳菇(L.akahatsu)和鲑色乳菇(L.salmonicolor)共25个子实体样本的基因组DNA,扩增ITS序列,对GenBank下载和本次及以前测序的松乳菇ITS序列的碱基组成、变异位点及碱基替换类型进行分析,从GenBank下载乳菇属其它8个种,构建乳菇系统发育树。结果显示:松乳菇ITS序列共有20 bp长度的变化,碱基C、T含量大于G、A含量。变异位点ITS共有99个(ITS1 58个、5.8S 4个、ITS2 37个),其中主要是T与C的转换,转换与颠换位点数分别为8和5。ITS1、5.8S、ITS2中转换与颠换的比值R分别为2.34、1.95、1.12。基于ITS序列计算不同地区松乳菇间的遗传距离,江西与意大利、西班牙,法国与西班牙序列间的遗传距离最大为0.012,云南和法国序列间遗传距离为0,是同源序列。系统发育树显示:松乳菇和红汁乳菇、橙色乳菇亲缘关系较近。