侵染梨的苹果茎痘病毒基因组序列及小RNA分析

编号 zgly0001557414

文献类型 期刊论文

文献题名 侵染梨的苹果茎痘病毒基因组序列及小RNA分析

作者 刘华珍  杨作坤  周友斌  王国平  洪霓 

作者单位 华中农业大学农业微生物国家重点实验室  华中农业大学植物科学技术学院湖北省作物病害检测与安全控制重点实验室 

母体文献 植物病理学报 

年卷期 2017年05期

年份 2017 

分类号 S432.41 

关键词 苹果茎痘病毒  梨  基因组  小RNA 

文摘内容 苹果茎痘病毒(Apple stem pitting virus,ASPV)是危害梨(Pyrus spp.)和苹果(Malus spp.)的重要病毒。本研究采用小RNA深度测序技术获得了ASPV基因组的部分序列,在此基础上设计引物对该病毒基因组进行RT-PCR扩增,通过序列拼接得到1个来源于玉露香(Yuluxiang)梨的ASPV分离物(YLX)长度为9 291个核苷酸(nt)(不包括基因组5’末端约30个核苷酸)的基因组序列,该序列与已报道的13个ASPV分离物的基因组核苷酸序列相似性为71.6%~80.7%,与多个来自苹果的ASPV分离物系统进化关系较近。首次分析了来源于ASPV基因组的干扰性小RNA(siRNA),发现来源于ASPV基因组链和互补链的siRNA长度均以21 nt和22 nt为主,siRNA的5’端具有一定的碱基偏好性。本研究结果为深入了解ASPV的分子特性提供了重要信息。