苹果全基因组多聚半乳糖醛酸酶基因家族的鉴定及进化分析

编号 zgly0001525344

文献类型 期刊论文

文献题名 苹果全基因组多聚半乳糖醛酸酶基因家族的鉴定及进化分析

作者 陈鸿飞  邵红霞  樊胜  马娟娟  张东  韩明玉 

作者单位 西北农林科技大学园艺学院 

母体文献 园艺学报 

年卷期 2016年10期

年份 2016 

分类号 S661.1 

关键词 苹果  PG  家族分析  生物信息学 

文摘内容 从苹果全基因组中鉴定出85个多聚半乳糖醛酸酶(PG)基因,通过聚类分析将其分成了7个组(Group A~Group G),其分子量在176~1 125 aa之间,等电点在4.68~9.58之间。鉴定出来的Md PG基因除在14号染色体没有分布外,其余都有分布。系统分析了Md PG蛋白的保守基序和Md PG基因结构,发现苹果PG蛋白除包含有广泛存在于各种PG蛋白的4个保守基序以外,还含有其他相对特异的保守基序,Md PG75具有最多的外显子数,达到18个。对85个苹果PG蛋白之间的功能联系网络进行了系统研究,分析预测了相关基因的功能和多个基因间功能的联系,并作了初步验证。