拟松材线虫组织蛋白酶基因Bmcath1的序列分析与转录水平检测

编号 zgly0001480909

文献类型 期刊论文

文献题名 拟松材线虫组织蛋白酶基因Bmcath1的序列分析与转录水平检测

作者 潘妍毅  黄麟  吴小芹 

作者单位 南京林业大学南方现代林业协同创新中心  江苏省有害生物入侵预防与控制重点实验室南京林业大学林学院 

母体文献 南京林业大学学报(自然科学版 

年卷期 2015年06期

年份 2015 

分类号 S763.18 

关键词 拟松材线虫  组织蛋白酶  系统发育树  表达谱分析 

文摘内容 拟松材线虫组织蛋白酶基因Bmcath1是一个在松材线虫与拟松材线虫中差异表达的基因,为了解该基因的生物学功能,对Bmcath1基因进行了生物信息学分析。笔者使用BioEdit、SignalP 4.1、BLASTP、MEGA 4.0等软件对Bmcath1基因进行了生物信息学分析,发现Bmcath1 cDNA序列全长1 294 bp,含有一个长度为1 158 bp的开放阅读框。由Bmcath1基因编码的蛋白质CATH1含有386个氨基酸,分子质量为4238 ku,等电点为8.52。蛋白质CATH1存在一个Peptidase_C1A subfamily功能域结构,在不同物种上的氨基酸序列多样性丰富。采用Real-Time PCR方法对不同培养方式获得的拟松材线虫中Bmcath1基因的表达量进行检测,发现该基因在分离自黑松的拟松材线虫中高量表达,据此推测拟松材线虫Bmcath1基因可能在线虫处于松树体内生长、繁殖时发挥更为重要的作用。