基于SSR标记的赣南柑桔黄龙病菌遗传多样性分析

编号 zgly0001526436

文献类型 期刊论文

文献题名 基于SSR标记的赣南柑桔黄龙病菌遗传多样性分析

作者 卢占军  刘映雪  丁鹏  赵培娅  黄爱军  苏华楠  钟八莲 

作者单位 赣南师范大学生命与环境科学学院  国家脐橙工程技术研究中心 

母体文献 中国南方果树 

年卷期 2016年05期

年份 2016 

分类号 S436.66 

关键词 赣南  柑桔黄龙病菌  简单重复序列  种群结构 

文摘内容 从已报道的韧皮部杆菌基因组的23个SSR位点中筛选出3个位点(LasSSR-C、LasSSRD、CWBJ44),用于赣南14个县(区、市)的342份柑桔黄龙病菌样品的遗传多样性及各地种群结构的分析。结果表明,赣南地区柑桔黄龙病菌种群在LasSSR-C、LasSSR-D和CWBJ44位点的Nei’s多样性指数H分别为0.734 6、0.576 2和0.291 3,赣州西南部县(区、市)的多样性指数H比东北部高;大余县的等位基因与其他县(区、市)区别较大。Powermarker软件UPGMA聚类分析将所有样品分为两个组群,大余县单独列为一个组群,其余县(区、市)聚为一个组群。Structure软件聚类分析也得出了相似的结果,大余县的种群构成较为单一,91.8%的样品属同一组群,而其他县(区、市)的种群则是由两个组群菌株按不同比例混合构成。