希金斯炭疽菌PITP生物信息学分析

编号 zgly0000938539

文献类型 期刊论文

文献题名 希金斯炭疽菌PITP生物信息学分析

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 韩长志 

作者单位 西南林业大学林学院/云南省森林灾害预警与控制重点实验室 

母体文献 湖北农业科学 

年卷期 2015(3)

页码 713-716+721

年份 2015 

关键词 希金斯炭疽菌(Colletotrichum higginsanum Sacc.)  磷脂酰肌醇转移蛋白质  生物信息学分析  遗传关系  炭疽菌属 

文摘内容 以酿酒酵母中已经报道的5个典型PITP序列为基础,对炭疽菌属蛋白质数据库进行Blastp比对以及关键词搜索,并通过SMART保守结构域分析,明确该菌含有4个典型的PITP;同时,通过对上述氨基酸序列进行疏水性、细胞信号肽、跨膜区结构域、亚细胞定位以及二级结构等生物信息学分析,并与其他物种中15个同源序列进行遗传关系比较分析,以期为深入开展希金斯炭疽菌(Colletotrichum higginsanum Sacc.)PITP的功能研究打下理论基础,同时,也为进一步开展其他炭疽菌的研究提供重要的理论指导。