山枇杷基因组DNA的提取及自然群体内ISSR遗传多样性分析

编号 zgly0001480220

文献类型 期刊论文

文献题名 山枇杷基因组DNA的提取及自然群体内ISSR遗传多样性分析

作者 赖瑞联  徐洋  赖恭梯  钟春水  林玉玲  赖钟雄 

作者单位 福建农林大学园艺植物生物工程研究所 

母体文献 森林与环境学报 

年卷期 2015年01期

年份 2015 

分类号 S567.19 

关键词 山枇杷  自然群体  改良十六烷基三甲基溴化铵法  简单序列重复区间  聚类分析 

文摘内容 为探究山枇杷基因组DNA提取方法及群体内个体之间的遗传多样性,以采自福建省戴云山脉九仙山山枇杷(Garcinia multiflora)自然群体的41份叶片样品为材料,比较2种改良十六烷基三甲基溴化铵法(CTAB)对其基因组DNA的提取效果,并通过简单序列重复区间—聚合酶链式反应(ISSR-PCR)扩增反应体系分析其群体内遗传多样性。结果表明,CTAB-2法通过适当提高CTAB浓度,添加聚乙烯吡咯烷酮(PVP)和酚—氯仿—异戊醇,获得的基因组DNA纯度和质量较好;筛选的11条ISSR引物共扩增85个条带,其中多态性条带61条,占71.76%;NTSYS 2.10e软件设定阈值(GS)为0.78,该山枇杷样品归为4个类群,样品遗传相似系数介于0.588-0.929,平均为0.779,说明该群体的遗传基础较宽;利用STRUCTURE 2.2软件将样品分为4个类群,结合后验概率(Q值)分布表表明部分个体之间存在较丰富的遗传信息交流。