杉木育种群体SSR分子标记遗传多样性分析

编号 zgly0001479682

文献类型 期刊论文

文献题名 杉木育种群体SSR分子标记遗传多样性分析

作者 欧阳磊  陈金慧  郑仁华  徐阳  林宇峰  黄金华  叶代全  方扬辉  施季森 

作者单位 南京林业大学  林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室  福建省林业科学研究院  国家林业局南方山地用材林培育重点实验室  福建省洋口国有林场国家杉木种质资源库 

母体文献 南京林业大学学报(自然科学版 

年卷期 2014年01期

年份 2014 

分类号 S791.27 

关键词 杉木  育种群体  SSR标记  遗传多样性管理 

文摘内容 杉木的育种群体中,维持合理的遗传多样性和清晰的遗传背景,是长周期、多世代遗传改良采用的核心策略之一。基于基因组分子标记,利用自主开发的52对杉木SSR引物,对国家级杉木种质资源库保存的遗传材料——杉木第1代遗传改良收集的93份种质资源进行了遗传多样性分析。结果表明:52对SSR引物在93份材料中共检测到254个等位变异,等位变异范围为2~8个,平均等位基因数为4.88个,平均有效等位基因数为2.32个,平均观察杂合度为0.43,平均Nei’s多样性指数为0.50,平均Shannon信息指数为0.98,这5个评价遗传多样性水平的指标具有较大程度的一致性。不同引物的等位基因数、有效等位基因数、观察杂合度、多样性指数和Shannon信息指数等均表明杉木育种群体中存在较大的遗传差异,其变异系数分别为24.88%、44.75%、34.20%、34.89%和33.59%。93份种质资源间遗传相似系数的平均值为0.693 3,变化范围为0.490 0~0.9193;遗传距离的平均值0.370 3,变化范围为0.086 3~0.713 4。当距离阀值为20时,可将杉木第1代育种群体中的93份种质资源划分为5大类;当距离阀值为15时,第5大类的77份种质资源可细分为16个亚类。SSR分子标记聚类的结果可为种质资源的管理及提高育种效率提供重要依据。