球毛壳菌cox5基因克隆及特性分析

编号 zgly0000508623

文献类型 期刊论文

文献题名 球毛壳菌cox5基因克隆及特性分析

作者 胡坤  杨谦  刘志华 

作者单位 哈尔滨工业大学 

母体文献 东北林业大学学报 

年卷期 2007,35(4)

页码 36-40

年份 2007 

分类号 Q933 

关键词 cox5  球毛壳菌  基因克隆  特性分析  生物信息学 

文摘内容 利用BlastX将球毛壳菌(Chaetomium globosum)ESTs序列与GenBank的Nr数据库进行相似性搜索, 获得含有细胞色素C氧化酶亚基5基因(cox5)全长cDNA序列的EST(BP099084), 以此设计引物。以球毛壳菌总RNA反转录产物为模板进行PCR扩增, 获得球毛壳菌cox5的cDNA序列。cDNA全长685bp, 编码169个氨基酸的多肽, 蛋白质分子量18.3KD。蛋白质家族预测其属于cox4家族。球毛壳菌cox5是具有导肽的跨线粒体内膜的蛋白质。BlastP相似性分析表明cox5氨基酸序列保守性不高, 与其相似性最高的是柄孢霉的cox5(Podospora anserina, CAB76570), 相似性为75%。cox5基因的cDNA序列及推测的氨基酸序列在GenBank上登录(登录号分别为DQ082750、AAY85812)。