广西高致病性PRRSV Nsp2基因的克隆、序列分析和抗原表位预测

编号 zgly0001340102

文献类型 期刊论文

文献题名 广西高致病性PRRSV Nsp2基因的克隆、序列分析和抗原表位预测

作者 谢丽基  谢芝勋  刘加波  庞耀珊  谢志勤  邓显文  唐小飞 

作者单位 广西兽医研究所  广西兽医研究所 广西南宁530001  广西南宁530001 

母体文献 动物医学进展 

年卷期 2008年01期

年份 2008 

分类号 S852.65 

关键词 猪繁殖与呼吸综合征病毒  Nsp2基因  克隆  序列分析 

文摘内容 根据猪繁殖与吸吸综合征病毒(PRRSV)VR2332 Nsp2基因序列合成特异性引物,对广西分离的高致病性PRRSV进行RT-PCR扩增,将扩增出的796 bp片段插入pMD18-T载体中进行序列测定和分析,并用DNA Star软件对Nsp2基因推导的氨基酸序列进行了表位分析。结果显示,广西3个县、市的PRRSV分离株Nsp2基因第483位和第532位~第560位氨基酸发生缺失,核苷酸序列之间的同源性为97.0%~97.4%,推导编码的氨基酸序列之间的同源性为93.6%~94.7%;与PRRSV VR2332株、MLV株和CH-1a株核苷酸之间的同源性分别为79.0%~79.2%、78.8%~78.9%和88.2%~89.3%;氨基酸之间的同源性分别为59.4%~60.2%、59.4%~60.2%和70.9%~81.6%,表明广西3个县、市的PRRSV分离株Nsp2基因与VR2332株、MLV株和CH-1a株比较变异较大。表位分析表明,由于博白株的Nsp2基因的第532位~560位氨基酸的缺失,与VR2332株比较,其亲水性、抗原指数均发生了大的变化。