马尾松毛虫线粒体全基因组的测定与分析

编号 zgly0001685112

文献类型 期刊论文

文献题名 马尾松毛虫线粒体全基因组的测定与分析

作者 杜会聪  王瑶  方加兴  张珍荫  张苏芳  刘福  张真  孔祥波 

作者单位 中国林业科学研究院森林生态环境与保护研究所国家林业和草原局森林保护学重点实验室  东北林业大学林学院  云南省丽江市玉龙纳西族自治县林业局 

母体文献 林业科学 

年卷期 2019年12期

年份 2019 

分类号 S763.42 

关键词 鳞翅目  枯叶蛾科  马尾松毛虫  线粒体基因组  系统发育 

文摘内容 【目的】测定和分析马尾松毛虫线粒体基因组的特征,从线粒体基因组水平探究蛾类昆虫高级阶元的系统发育关系。【方法】采用Hi Seq X Ten测序仪测定马尾松毛虫线粒体的全基因组序列,参考鳞翅目昆虫已知线粒体基因组的全序列对其各基因进行定位和注释。采用tRNA Scan-SE 2. 0软件预测tRNA基因的二级结构。基于线粒体全基因组的核苷酸序列构建鳞翅目蛾类13个科50种昆虫的系统发育关系。【结果】马尾松毛虫线粒体基因组全长15 417 bp,A+T含量为79. 6%,包括13个蛋白质编码基因、22个tRNA基因、2个rRNA基因和一段长度为320 bp的A+T富含区,无基因重排。13个蛋白质编码基因中,氨基酸使用较频繁的依次包括Phe、Leu、Ile、Tyr和Asn(Count>290),而Ala和Arg的使用相对较少(Count<50);在其密码子使用中,除COI以CGA为起始密码子外,其余基因的起始密码子均为昆虫典型的ATN(ATA、ATT、ATG);终止密码子除COI、COII和ND4基因为T外,其他基因的均为TAA。在所测得22个tRNA基因中,tRNASer(AGN)缺少DHU臂,其余tRNA均为典型的三叶草结构。A+T富含区存在1段由ATAGAA引导保守长度为14 bp的多聚T结构和2段长度为13 bp的重复单元以及1个(AT)7结构。马尾松毛虫与其他松毛虫属的线粒体基因组全序列及13个蛋白质编码基因的核苷酸序列进行比对分析,结果表明,马尾松毛虫与文山松毛虫和油松毛虫三者间具有较高的同源性。系统发育树的结果显示:马尾松毛虫与油松毛虫亲缘关系最近,思茅松毛虫和赤松毛虫亲缘关系最近。【结论】马尾松毛虫线粒体基因结构稳定,基于线粒体基因组构建的鳞翅目蛾类昆虫的系统发育关系与传统的形态分类学结果基本一致。