我国部分苹果产区苹果锈果类病毒的检测和全序列分析

编号 zgly0001561320

文献类型 期刊论文

文献题名 我国部分苹果产区苹果锈果类病毒的检测和全序列分析

作者 陈冉冉  谢吉鹏  叶婷  董云浩  国立耘  周涛 

作者单位 中国农业大学植物病理学系 

母体文献 植物保护 

年卷期 2017年06期

年份 2017 

分类号 S436.611.1 

关键词 苹果  苹果锈果类病毒  RT-PCR  变异分析  系统发育 

文摘内容 近年来,由苹果锈果类病毒Apple scar skin viroid(ASSVd)引起的苹果花脸病、锈果病在我国一些苹果产区日趋严重,对我国苹果生产和苹果产业发展造成严重危害。为了解ASSVd在我国一些苹果产区的发生和变异情况,采用RT-PCR对陕西、山东、山西、河北、北京和黑龙江6个苹果产区的35份苹果样品进行检测,并克隆获得30个分离物的基因组全序列,大小为330~333个核苷酸。分析表明,这些分离物的基因组全序列与GenBank中ASSVd基因组核苷酸序列相似度为96%~100%,在苹果锈果类病毒属的末端保守区及中央保守区保守,在致病区和左端区域有突变,一些分离物的突变位点相同。系统发育分析表明分离物因相同的突变位点而聚类,而与地理来源无关。