花生AhLRPK1基因的克隆及生物信息学分析

编号 zgly0001639742

文献类型 期刊论文

文献题名 花生AhLRPK1基因的克隆及生物信息学分析

作者 庄瑞蓉  储文婷  赵闪闪  陈坤  谢文萍  王自帅  赵国旗  陈伟  张冲 

作者单位 福建农林大学生命科学学院  闽台作物有害生物生态防控国家重点实验室 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2018年11期

年份 2018 

分类号 Q943.2  S565.2 

关键词 AhLRPK1  受体蛋白激酶  抗病防御  生物信息预测  表达分析 

文摘内容 植物受体蛋白激酶参与植物的生长发育,抗逆抗病防御反应、细胞分化、在宿主与病原菌互作过程中起着重要的作用。目前在花生上蛋白激酶基因研究较少。本研究基于前期多态性SNP标记的开发和QTL定位,获得了一个抗青枯病候选蛋白激酶基因;通过RT-PCR克隆技术获得了一段长为2 154 bp的ORF序列,暂命名为AhLRPK1;采用生物信息学方法预测并分析AhLRPK1基因编码的蛋白质常规理化性质,跨膜结构域、进化分析和高级结构等。结果表明AhLRPK1基因编码717个氨基酸为稳定的亲水性蛋白,含有一个信号肽、跨膜结构域、多个LRR基序以及一个激酶结构域;与拟南芥LRR亚家族进化同源性分析显示AhLRPK1属于LRRⅤ亚家族,与拟南芥的AT3G13065蛋白亲缘关系最近;AhLRPK1基因在花生基因芯片中表达模式分析表明,在茎和花中的表达量最大,在青枯菌诱导情况下,AhLRPK1基因在抗感花生品种中都表现出下调表达的趋势,AhLRPK1基因受乙烯利表达下调。这些结果有助于进一步验证其生物功能。