西伯利亚蓼几丁质酶基因Class IV克隆及生物信息学分析

编号 zgly0001349027

文献类型 期刊论文

文献题名 西伯利亚蓼几丁质酶基因Class IV克隆及生物信息学分析

作者 刘关君  刘昌财  刘明坤  魏志刚  刘桂丰 

作者单位 林木遗传育种与生物技术教育部重点实验室东北林业大学 

母体文献 植物生理学通讯 

年卷期 2008年03期

年份 2008 

分类号 Q943.2 

关键词 西伯利亚蓼  几丁质酶(CHI)  RACE  GPI锚 

文摘内容 根据西伯利亚蓼抑制消减文库(SSH)中获得的几丁质酶(CHI)基因的部分序列,采用RACE技术克隆了具完整编码区的cDNA序列,基因全长1 017 bp,开放阅读框编码270个氨基酸。序列分析表明,该基因的编码蛋白(PsCHI1)以前体形式存在,N端分别有22个氨基酸的信号肽和35个氨基酸的几丁质结合域(CBD),C端199个氨基酸为催化区(CD),连接CBD与CD的14个氨基酸为可变交联区,成熟蛋白为不含信号肽部分,呈碱性,带正电荷。PsCHI1与所选其它植物classⅣCHI前体序列具有高度的同源性(53%～69%),而与classⅠ和classⅡCHI的氨基酸序列同源性较低,推测为植物classⅣCHI。根据日本水稻CHI晶体结构构建了PsCHI1三维分子模型,分析显示PsCHI1可以识别比classⅠ和classⅡCHI短的几丁质片段,并以其它植物CHI的已知结构域和功能为基础,确定PsCHI1具有能够水解真菌细胞壁的结构,推测其可能有抗病原微生物的功能。