基于2b-RAD技术的糯玉米品种‘沪玉糯3号’特异SNP分子标记开发

编号 zgly0001706536

文献类型 期刊论文

文献题名 基于2b-RAD技术的糯玉米品种‘沪玉糯3号’特异SNP分子标记开发

作者 卢媛  韩晴  王义发  施标  沈雪芳 

作者单位 上海市农业科学院作物育种栽培研究所  CIMMYT-中国特用玉米研究中心 

母体文献 植物生理学报 

年卷期 2020年03期

年份 2020 

分类号 S513 

关键词 糯玉米‘沪玉糯3号’  2b-RAD  SNP  品种特异性 

文摘内容 利用2b-RAD (type IIB endonucleases restriction-site associated DNA)技术对糯玉米品种‘沪玉糯3号’及其亲本进行简化基因组测序。通过与玉米‘B73’参考基因组序列进行比对,在3个糯玉米样品的共同测序标签内筛选出20 498个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)位点,并基于RADtyping分型策略对它们进行基因型分型。对其中20 333个位于玉米10条染色体上的SNP位点的基因型进行分析,开发出6个可用于‘沪玉糯3号’品种特异性鉴定的SNP分子标记。