鸽圆环病毒福建株全基因组序列分析

编号 zgly0001400787

文献类型 期刊论文

文献题名 鸽圆环病毒福建株全基因组序列分析

作者 万春和  黄瑜  程龙飞  傅光华  施少华  陈红梅 

作者单位 福建省农业科学院畜牧兽医研究所 

母体文献 中国动物传染病学报 

年卷期 2011年05期

年份 2011 

分类号 S852.65 

关键词 鸽圆环病毒  全基因  序列分析 

文摘内容 运用PCR技术从福建省某地发病信鸽组织中获得鸽圆环病毒(Pigeon circovirus,PICV)福建株(简称fj1株)全基因组序列,并对鸽圆环病毒福建株基因组核苷酸组成、结构及其遗传进行分析。结果表明,所获fj1株全基因大小2037 nt,包含有2个主要的开放阅读框(open reading frame,ORF):ORF-V1(41～994nt)编码复制相关结构蛋白(the replicated-associated protein,Rep),ORF-C1(1987～1166nt)编码核衣壳蛋白(the putative capsid protein,Cap);在V1和C1的5’端之间存在一个与圆环病毒滚环复制有关的高度保守的环状发夹结构。fj1株与GenBank登录所有鸽圆环病毒核苷酸同源性在84.5%～93.8%之间,与中国浙江鸽圆环病毒分离株zj1和zj2核苷酸同源性分别为88.7%和88.9%。从遗传进化上看,中国3株鸽圆环病毒均处在Cap蛋白起始密码子ATG分支,但分居不同亚群。