基于简化基因组测序技术的番茄雄性不育基因定位

编号 zgly0001570052

文献类型 期刊论文

文献题名 基于简化基因组测序技术的番茄雄性不育基因定位

作者 王柏柯  李宁  唐亚萍  王强  杨涛  杨生保  帕提古丽  余庆辉  高杰 

作者单位 新疆农业大学林学与园艺学院  新疆农业科学院园艺作物研究所 

母体文献 西北农林科技大学学报(自然科学版 

年卷期 2017年06期

年份 2017 

分类号 S641.2 

关键词 番茄  雄性不育  简化基因组测序  基因定位 

文摘内容 【目的】获得番茄雄性不育基因的候选基因,提高番茄雄性不育基因定位的准确性,为该雄性不育基因的克隆及功能机制研究提供理论基础。【方法】以一个与苗期绿茎基因紧密连锁的花粉败育型材料为母本,以一个苗期紫茎可育系为父本,通过集群分离(BSA)法分别建立30个F2单株的不育和可育DNA池,基于简化基因组测序(SLAF-Seq)技术检测足够量的简化基因组扩增片段,通过关联分析,获得目标雄性不育基因的候选区域,并利用GO数据库对关联区域内的基因进行功能注释。【结果】通过SLAF测序共获得20.27 Mb的序列量;共获得103 250个SLAF标签,标签整体平均深度达160.39倍;完成了2个混合池间SLAF标签标记的多态性分析,共获得多态性标记6 892个;利用2个混合池进行关联分析,共得到8个与目标雄性不育基因相关的候选区域,区域平均大小为0.29Mb,区域内共有27个差异标记,146个候选基因。【结论】利用SLAF测序技术对番茄雄性不育基因进行了初步定位。