绿色棉苯丙氨酸解氨酶基因GhPAL1的克隆和实时定量表达分析

编号 zgly0001433929

文献类型 期刊论文

文献题名 绿色棉苯丙氨酸解氨酶基因GhPAL1的克隆和实时定量表达分析

作者 赵伟涛  李艳军  张新宇  吴莉  孙杰 

作者单位 石河子大学生命科学学院  石河子大学农学院  新疆生产建设兵团绿洲生态农业重点实验室 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2012年03期

年份 2012 

分类号 S562 

关键词 绿色棉  苯丙氨酸解氨酶  实时荧光定量PCR 

文摘内容 本研究以拟南芥(Arabidopsis thaliana)苯丙氨酸解氨酶(PAL)基因cDNA序列(AAC18870.1)为探针,在GenBank中与棉花EST进行tBLASTn比对,将同源性高的EST序列拼接后获得一条棉花PAL全长cDNA基因序列,以此序列为模板设计引物,通过RT-PCR扩增从绿色棉纤维分离出了一个绿色棉PAL基因全长cDNA序列,将该基因命名为GhPAL1(GenBank登录号:JN032297)。序列分析表明,该cDNA全长2347bp,含有一个编码721个氨基酸的开放阅读框。实时荧光定量PCR分析发现:该基因在绿色棉纤维中的表达模式与白色棉纤维相似,但两者在同一时期的表达量差异显著,其在花后6d绿色棉纤维细胞中的表达量是同期白色棉的6倍以上,从该基因的表达特征推测GhPAL1基因可能在绿色棉纤维色素合成过程中发挥重要作用。