菊花矮化类病毒的分子检测与序列分析

编号 zgly0001398171

文献类型 期刊论文

文献题名 菊花矮化类病毒的分子检测与序列分析

作者 张志想  葛蓓孛  潘嵩  赵哲  王红清  李世访 

作者单位 中国农业科学院植物保护研究所植物病虫害生物学国家重点实验室  中国农业大学农学与生物技术学院果树系 

母体文献 园艺学报 

年卷期 2011年12期

年份 2011 

分类号 S436.8 

关键词 菊花  菊花矮化类病毒  斑点杂交  RT-PCR  序列分析 

文摘内容 菊花矮化病由菊花矮化类病毒(Chrysanthemum stunt viroid,CSVd)引起。从北京、海南万宁、合肥和哈尔滨共采集了122个野生及商业种植的菊花样品,使用改进的CTAB法提取菊花总RNA后,通过斑点杂交检测CSVd,应用RT-PCR对阳性样品进行克隆、测序。斑点杂交结果表明,在检测的122个样品中有14个样品感染了CSVd,感染率为11.5%;除哈尔滨外的其余3个地区均有CSVd的发生。序列比较分析结果表明,中国的CSVd分离物与韩国和日本分离物的序列最为接近,对其二级结构进行分析发现,与CSVd的参考序列(NC002015)相比,所获得的中国CSVd分离物的序列中虽然有21个碱基发生了突变(大多位于二级结构上的致病区内),但并未影响其折叠成稳定的拟棒状结构。